私立明德高中有一门神秘的选修课“秘密授课”，授课教师是一位戴面具的“X先生”，他用催眠术让学生进入自己的潜意识，直面内心恐惧和欲望。每节课后，学生都会发生惊人变化：霸凌者变得善良、自卑者变得勇敢、迷茫者找到方向。然而，X先生本人却隐藏着一个惊人的秘密——他曾经是这所学校最糟糕的学生，因意外获得能力，如今用这种方式赎罪。这是一部心理奇幻校园漫画。
学生们被带入潜意识空间，看到自己最恐惧的怪物，霸凌者田中看到的是被他欺负的同学的脸。
胆小女生在潜意识中变成巨人，打败了代表焦虑的黑影，醒后她主动报名演讲比赛。
学生看到自己内心最深处的欲望：有人想偷窃，有人想报复，X先生引导他们正视而非逃避。
一位老师认出X先生是多年前被开除的学生，他在校园论坛发帖揭露，引起轩然大波。
X先生向学生坦白自己曾因霸凌导致同学转学，他获得能力后决定用一生弥补，学生们选择原谅。
毕业生们集体回到课堂，X先生摘下口罩，露出普通的面孔，他说“秘密不是能力，而是善意”。